Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
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Trappc6bQ9D289 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Trappc6bQ9D289 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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