Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Spns3Q9D232 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Spns3Q9D232 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms