Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Tmem53Q9D0Z3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Tmem53Q9D0Z3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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