Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mms19Q9D071 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Mms19Q9D071 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms