Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc47Q9D024 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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