Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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