Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tdrd12Q9CWU0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms