Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Aff1-201ENSMUST00000031256 8312 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lhfpl3Q9CTN8 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms