Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Nicn1Q9CQM0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Nicn1Q9CQM0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Nicn1Q9CQM0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Nicn1Q9CQM0 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms