Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Tmed6Q9CQG0 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Tmed6Q9CQG0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms