Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prpf8Q99PV0 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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