Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
GpnmbQ99P91 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
GpnmbQ99P91 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms