Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl3Q99N95 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms