Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ms4a6bQ99N09 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms