Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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PtprtQ99M80 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprtQ99M80 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprtQ99M80 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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