Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp16Q99LG0 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms