Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Nmd3Q99L48 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms