Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rab28Q99KL7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms