Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CsprsQ99388 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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