Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Csmd1Q923L3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Csmd1Q923L3 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms