Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp3Q91W36 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Usp3Q91W36 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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