Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Dkk4Q8VEJ3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Dkk4Q8VEJ3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms