Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OptnQ8K3K8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms