Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vrk3Q8K3G5 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Vrk3Q8K3G5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
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