Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Prpf39Q8K2Z2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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