Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trim68Q8K243 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trim68Q8K243 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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