Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
FgbQ8K0E8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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FgbQ8K0E8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
FgbQ8K0E8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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