Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Znf628Q8CJ78 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Znf628Q8CJ78 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms