Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Cdkl1Q8CEQ0 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms