Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ccdc28aQ8CEI3 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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