Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nhsl1Q8CAF4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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