Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Spef2Q8C9J3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spef2Q8C9J3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms