Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Usp20Q8C6M1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp20Q8C6M1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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