Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RtknQ8C6B2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RtknQ8C6B2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms