Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Cnot2Q8C5L3 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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