Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rapgef5Q8C0Q9 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rapgef5Q8C0Q9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms