Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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