Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28365-202ENSMUST00000189584 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29117-202ENSMUST00000190374 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37462-201ENSMUST00000193386 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37721-202ENSMUST00000194673 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm14083-201ENSMUST00000117873 620 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm23046-201ENSMUST00000158369 284 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trim35Q8C006 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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