Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Usp38Q8BW70 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp38Q8BW70 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Usp38Q8BW70 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp38Q8BW70 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms