Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Usp1Q8BJQ2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Usp1Q8BJQ2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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