Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Clrn3Q8BHH8 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Clrn3Q8BHH8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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