Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Lrrtm2Q8BGA3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms