Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
ChfrQ810L3 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms