Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ell3Q80VR2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms