Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Clec18aQ7TSQ1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Clec18aQ7TSQ1 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Clec18aQ7TSQ1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms