Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kcnf1Q7TSH7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms