Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Dsg1bQ7TSF1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Dsg1bQ7TSF1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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