Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Vma21Q78T54 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Vma21Q78T54 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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