Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cnih3Q6ZWS4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms