Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Kcnt1Q6ZPR4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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